Troben errors en les seqüències genètiques del coronavirus incloses en la major base de dades mundial

   VALÈNCIA, 2 Abr. (EUROPA PRESS) -

   Un estudi liderat per l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio, UV-CSIC) ha detectat un volum molt superior d'errors de dades en les seqüències de certes mutacions del virus SARS-CoV-2, després de comparar la informació procedent de GISAID --principal base de dades utilitzada durant la pandèmia-- amb l'obtinguda de la seqüenciació directa de genomes.

   Els resultats, que posen de manifest els "punts febles" de les bases de dades públiques, ajudaran a millorar la vigilància del virus i, per tant, les metodologies de detecció viral i els processos d'intervenció clínica, han informat des de CSIC en un comunicat.

   El treball, recentment publicat en la revestisca Virus Evolution, presenta una nova perspectiva sobre la capacitat del virus SARS-CoV-2 per a mutar, de manera inusual, i infectar a humans. Els resultats indiquen que moltes de les seqüències amb reparació de mutacions en la proteïna spike del virus --la més variable de tot el genoma víric i la principal via d'infecció de cèl·lules humanes-- es van deure a errors introduïts per al seu processament en grans bases de dades genètiques.

   Segons l'estudi, els mètodes informàtics empleats per a analitzar milions de seqüències virals poden portar a error, generant la impressió de que el virus corregix un tipus de mutacions amb major freqüència de la real. En comparar estes dades ja processades amb la informació obtinguda directament de la seqüenciació de genomes, l'equip ha aconseguit obtenir una visió més realista dels canvis genètics que patix el virus.

   "Si s'estudien estes regions, esta part de la proteïna spike que s'ha perdut, i es confia en les dades processades, s'està sobreestimant la quantitat real de mutacions presents en esta seqüència d'ADN", ha assegurat Mireia Coscollà Devís, investigadora del CSIC en l'I2SysBio i líder del projecte. "Ens vam adonar que les seqüències de la base de dades de GISAID estan processades per cada laboratori de forma diferent i contenien moltes distorsions per a este tipus de marcadors", ha afegit la científica.